.

İsmailağa camiinin mazisi, orayı vakfeden Şeyhul-islam İsmail Efendi ile başlar. Aynı aileden olan İsmail Efendi ve diğer dört şeyhul-islam avludaki kabristanda yatmaktadır.

İsmail Efendi, Hicaz da şeyhul-islamlık vazifesi görmüş, İstanbula gelince yaşadığı evini Allah yoluna vakfetti. Camisinin kubbe altında kalan kısmı -sütunların arası- Kabe'nin ölçüsüne göredir.  Avlunun ötesinde kalan kısmı medrese olarak inşa ettirmiştir.

Osmanlıdan sonraki dönemde cami ve medrese harabeye dönmüş, hatta son dönem resimlerinde kubbenin üzerinde otlar ve ağaçlar bitmişti.

    1950 lerde Ali Haydar Efendi Baba k.s. nun emri ile tamir edildi ve Mahmud Efendi k.s. orada imamlık vazifesine başladı. Cami tamir edileceği zaman içeriyi bazı kimseler ev olarak kullanıyordu. Hatta minberin altından bir kaç el arabası insan pisliği atıldığı söylenmiştir.

Daha sonra camiye ilaveler yapılmış ve şimdiki halini almıştır. Fakat medrese bölümü hala daha kapalıdır, belki Kütüphane olarak kullanılması mümkün olabilir.